Réactifs d’électrophorèse pour ADN, ARN et protéines : comment assurer séparation et révélation des biomolécules ?

Au cœur de chaque séparation réussie : un gel maîtrisé et un tampon adapté. Notre sélection de réactifs d’électrophorèse couvre l’analyse des acides nucléiques et des protéines : agaroses haute résolution, gels pré-coulés (NA et PAGE), marqueurs de taille, bandelettes d’IEF (focalisation isoélectrique), colorants/fluorochromes, tampons TAE (Tris–Acetate–EDTA)/TBE (Tris–Borate–EDTA), Tris-Glycine, MOPS(3-(N-morpholino)propanesulfonic acid)/MES(2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid) et additifs clés (SDS Sodium Dodecyl Sulfate, DTT Dithiothreitol, urée). Formulés pour la reproductibilité, la sécurité et la performance, ils accélèrent vos workflows – du contrôle de PCR aux profils protéiques complexes.

Quels réactifs d’électrophorèse choisir, et pour quel usage ?

Pour l’ADN/ARN, optez pour l’agarose, standard pour les applications de routine ou low EEO / haute résolution pour la séparation fine de fragments, avec des concentrations comprises entre 0,7 et 3 % selon la taille des fragments. Des agaroses spécifiques peuvent être utilisées pour certaines applications particulières. Les tampons TAE (migration rapide, récupération facilitée) ou TBE (meilleure résolution des petits fragments, pouvoir tampon plus élevé) guident le choix du système de migration ; le SB (sodium borate) peut être utilisé pour des migrations rapides à plus haute tension sur gels d’agarose, dans des usages ciblés.
Pour les protéines, les gels PAGE (Laemmli, Bis-Tris, gradients), notamment en gels pré-coulés, améliorent la reproductibilité et limitent la manipulation d’acrylamide non polymérisé. En IEF, les bandelettes IPG fournissent des gradients de pH immobilisés et reproductibles, tandis que les ampholytes sont utilisés comme réactifs de support.
Côté détection de l’ADN/ARN, privilégiez des alternatives non mutagènes à l’EtBr selon votre système d’imagerie (ex. SYBR® Safe, GelRed®, EmeralDye™). Pour les protéines, utilisez la coloration Coomassie ou la coloration argentique selon la sensibilité visée. Les marqueurs de taille (ADN/ARN/protéines) servent de références de migration.

Critères clés : taille ou charge des analytes, sensibilité, compatibilité d’imagerie (UV ou lumière bleue), sécurité et considérations environnementales.

Type	Principe	Applications
Agarose	Séparation des ADN/ARN selon la taille des fragments en conditions natives	Contrôle de PCR, clonage, génotypage, QC de bibliothèques NGS
PAGE (SDS/native)	Séparation des protéines selon la masse moléculaire (SDS) ou la conformation/charge (native)	Profil protéique, analyse de pureté, estimation de masse moléculaire
IEF (IPG)	Séparation des protéines selon le point isoélectrique (pI) sur gradient de pH immobilisé	Protéomique, 2D-PAGE, analyse d’isoformes

Dans quels domaines utilise-t-on ces réactifs d’électrophorèse ?

• Sciences de la vie : contrôle de PCR, clonage, génotypage, QC de banques NGS.
• Pharmaceutique/biotech : caractérisation de bioprocédés, pureté et agrégats par SDS-PAGE, IEF d’anticorps.
• Agroalimentaire : traçabilité ADN, détection OGM, contrôle protéines allergènes.
• Environnement : empreintes ADN eDNA, biomarqueurs, suivi de contamination.
• Cosmétique/chimie : analyse de peptides/protéines, contrôle matières premières.
• Enseignement/R&D : démonstrations pédagogiques, optimisation de protocoles.
• Contrôle qualité : vérification de lots, comparaisons inter-séries avec marqueurs et gels pré-coulés pour une excellente reproductibilité.

Les différents réactifs et consommables d’électrophorèse disponibles

Questions fréquentes sur les réactifs d’électrophorèse

Quelle différence entre TAE et TBE pour l’ADN ?
Le TAE migre vite et facilite la récupération, le TBE offre une meilleure résolution des petits fragments et un tamponnement durable.

Quel pourcentage d’agarose choisir ?
0,7–1% pour grands fragments, 1,2–1,5% pour 0,5–3 kb, 2–3% pour petits fragments. Ajustez selon la vitesse souhaitée et la résolution cible.

Les gels pré-coulés valent-ils le coût ?
Oui si vous cherchez reproductibilité, gain de temps et sécurité. Idéal en QC et environnements réglementés.

Comment améliorer la sensibilité de détection protéines ?
Utilisez colorants Coomassie G-250 pour rapidité, argentique pour ultra-sensibilité, ou fluorochromes si vous disposez d’un imager compatible.

EtBr ou alternatives ?
Le bromure d’éthidium (EtBr) est un colorant très sensible pour l’ADN, mais il est mutagène et nécessite une visualisation sous UV, impliquant des contraintes de sécurité et de gestion des déchets. Des alternatives non mutagènes sont disponibles et doivent être choisies en fonction du mode d’excitation et du système d’imagerie. Les colorants à émission verte, comme SYBR® Safe, sont compatibles avec une excitation par lumière bleue, permettant une visualisation sans UV et limitant les dommages à l’ADN. Les colorants à émission rouge, comme GelRed®, offrent une excellente sensibilité, mais sont principalement excités par l’UV. Des solutions plus récentes, telles que EmeralDye™ (OwiBio), combinent les avantages des deux approches : forte sensibilité, compatibilité avec une excitation par lumière bleue ou verte, et meilleure sécurité d’utilisation, tout en restant adaptées aux applications en aval (extraction, clonage, NGS). Lorsque cela est possible, les alternatives à l’EtBr sont donc à privilégier, en tenant compte de la sensibilité requise et du système d’imagerie disponible.

Comment choisir un marqueur de taille ?
Sélectionnez une échelle couvrant votre plage, pré-teinté pour PAGE si besoin, et compatible avec votre système de détection (UV/fluorescence).

Conseils pour l’IEF avec bandelettes IPG ?
Hydratez correctement, utilisez ampholytes adaptés, évitez la surchauffe et stockez les IPG à l’abri de l’humidité et du gel/dégel répété.